研究院为国内最先开发Vero细胞基质的疫苗的单位之一，并在国际范围内率先研发成功了具有自主知识产权的冻干精制流行性乙型脑炎灭活疫苗（Vero细胞），使我国该类疫苗生产走在了世界前列。自2003年相继出现了新发传染病，疫苗研发中心及时调整研究方向，在转瓶工艺基础又开发了生物反应器培养细胞系统，建立了我国自主知识产权的哺乳动物细胞规模化（Vero细胞）关键技术平台，实现了动物细胞规模化培养的技术突破。通过该技术平台研发了SARS灭活疫苗，并完成了Ⅰ期临床研究；成功研发肠道病毒71型灭活疫苗（Vero细胞）并上市；成功研发脊髓灰质炎病毒灭活疫苗并已完成临床研究。