上海公司新发突发传染病应急反应平台依托于第四研究室研发团队和疫苗四室产业化团队，形成了以流感疫苗为代表的病毒类疫苗研发、中试、生产以及质量控制的系统平台。平台一方面立足于新发、突发流感疫情防控的国家需求，开展疫苗应急研发工作，为新发突发流感疫情防控提供产品与技术储备。另一方面，密切围绕流感疫苗技术创新方向，开展细胞基质流感疫苗、广谱流感疫苗、新型免疫佐剂等研发工作，为新型流感疫苗研发奠定技术基础。目前已有基于该平台的四种类型的流感疫苗获得临床试验批件并处于临床试验阶段。